litceysel.ru
добавить свой файл
1 2 3
Строение белков



Лекция 8

Строение полипептидов. Характеристика аминокислотных остатков – объем, степени свободы, гидрофильность, гидрофобность, зависимость свойств от рН

Конформации пептидной единицы.Карта Рамачандрана.

Уровни организации структуры белка.

Типы вторичных структур полипептидной цепи. Типы спиралей. Вета-цепи. Реверсивные повороты. Неупорядоченное состояние.

Относительное содержание разных типов вторичных структур.


Сверх вторичные структуры. Бета-листы. Бета-баррели. Суперспирали.

Структурные домены. Свойства доменов. Типы доменов. Предпочтительность доменной организации белковой молекулы. Понятие о пространственном фолде. Примеры фолдов. Топологические ограничения при формировании фолдов. Конечноть числа фолдов. Банк данных трехмерных пространственных структур молекул белков.

Строение полипептидов


Белки – линейные полимеры из аминокислотных остатков

Аминокислоты








L - конфигурация



Полимерная цепь




i i+1



Пептидная связь С=N - частично двойная - транс конфигурация

Углы вращения в пептидной цепи



Атомы

соседних пептидных единиц

лежат в одной плоскости


Степени свободы – углы вращения

 : C’(i-1)-- Ni==Cai -- C’i

 : Ni-- Cai -- C’i -- Ni+1

: Cai -- C’i -- Ni+1-- Cai+1